Ở trận đấu tại vòng loại World Cup 2026 giữa Bolivia và Argentina tại La Paz hôm 13/9, Messi không thi đấu. Thậm chí HLV Lionel Scaloni còn không đăng kí anh cho trận này. Theo truyền thông Argentina, Messi không hề bị chấn thương. Thủ quân ĐT Argentina không được đăng kí vì thể lực không đảm bảo.
"Messi chưa sẵn sàng. Cậu ấy đã cố gắng hồi phục nhưng không cảm thấy thoải mái. Chúng tôi quyết định không mạo hiểm với Messi”, Scaloni nói sau trận đấu tại La Paz. "Việc để Messi ra sân là không cần thiết vì những trận đấu quan trọng sắp diễn ra. Đó là một trận đấu khó khăn, và cậu ấy sẽ có nguy cơ chấn thương ngay cả khi vào sân từ ghế dự bị".
Dù không được đăng kí nhưng El Pulga vẫn xuất hiện trên băng ghế dự bị của ĐT Argentina. Theo TNT Sports (Argentina), lợi dụng lỗ hổng trong quy định của FIFA, LĐBĐ Argentina đã đăng kí Messi làm trợ lý cho H