Houllier gặp vấn đề về mạch máu đe dọa tới tính mạng trong cuộc so tài với Leeds tại Premier League năm 2001 - thời điểm ông đang nắm quyền ở Liverpool.

Houllier nhanh chóng được đưa tới bệnh viện và phải trải qua 11 giờ phẫu thuật tim hở sau khi mắc một chứng bệnh tim được gọi là "lóc tách thành động mạch chủ".

Houllier bắt đầu dẫn dắt Liverpool vào hè 1998, ban đầu là đồng HLV trưởng cùng với Roy Evans, trước khi được bổ nhiệm làm thuyền trưởng duy nhất của đội bóng 4 tháng sau đó. Ông đã tạo ra cuộc tái thiết lớn ở The Reds bằng việc đưa về một loại cầu thủ sau này trở thành công thần của CLB như Sami Hyypia, Dietmar Hamann và Vladimir Smicer.

Các phương pháp huấn luyện của Houllier nhanh chóng thu về quả ngọt khi Liverpool đoạt "cú ăn 3" độc nhất ở mùa 2000/01 (gồm FA Cup, UEFA Cup và Cúp Liên Đoàn), cùng với đó là giúp The Reds về đích thứ 3 tại Champions League.

Năm 2002, Houllier được trao tặng Legion d'Honneur - một trong những giải thưởng dân sự hàng đầu của Pháp. Ông chủ yếu được ghi nhận là người đặt nền móng cho sự thống trị của đội tuyển quốc gia trên bản đồ bóng đá thế giới, sau khi hệ thống học viện của Pháp được thành lập.

Sau khi rời Liverpool năm 2002, Houllier chuyển sang dẫn dắt Lyon rồi Aston Villa trước khi "rửa tay gác kiếm" vào năm 2011. Cho tới nay, nhà cầm quân 73 tuổi vẫn được coi là một trong những HLV vĩ đại nhất lịch sử của Liverpool.

Hay tin Houllier qua đời, cựu danh thủ Gary Lineker là một trong những người đầu tiên bày tỏ sự thương tiếc trên mạng xã hội Twitter. Ông viết: "Không. Gerard Houllier đã qua đời. Một trong những người thông minh nhất, ấm áp nhất và đáng yêu nhất của bóng đá. #RIPGerard".