Pepe, 35 tuổi, từng trải qua 3 mùa giải tại Porto từ năm 2004 đến năm 2007, giành hai chức vô địch trước khi chuyển đến Real Madrid với giá 30 triệu euro (27 triệu bảng).
Tại câu lạc bộ Hoàng gia Tây Ban Nha, anh đã trải qua một thập kỷ thành công với 3 chức vô địch La Liga, 2 Cúp Nhà Vua, 2 Siêu Cúp Tây Ban Nha, 3 chức vô địch Champions League, 1 Siêu Cúp châu Âu và 2 FIFA Club World Cup.
Sau khi rời Real, Pepe đã chuyển tới thi đấu tại Thổ Nhĩ Kỳ cho Besiktas vào năm 2017. Nhưng đến đầu mùa giải 2018/19, Pepe đã trở thành cầu thủ tự do hồi tháng 12 vừa qua, sau khi đạt thỏa thuận chấm dứt hợp đồng với đội bóng Thổ Nhĩ Kỳ.
Dù đã 35 tuổi nhưng Pepe vẫn là cái tên thu hút được sự quan tâm của khá nhiều đội bóng. Ngoài các câu lạc bộ tại giải Ngoại hạng Anh như Arsenal hay Wolves, anh cũng được liên hệ với Monaco ở Pháp, Al Gharafa của Qatar và Al Ittihad của Saudi Arabia.