Theo thống kê, Lewandowski khi đá cho Dortmund và Barca đã chạm trán Bayern tổng cộng 16 lần. Ở 16 trận này, có đến 13 trận anh bất lực trong việc xuyên thủng phòng tuyến của Hùm xám. Trong 3 trận còn lại, cựu tiền đạo Dortmund có 5 lần ghi tên mình lên bảng tỷ số. Đáng chú ý, đến thời điểm hiện tại Lewandowski vẫn chưa có nổi pha kiến tạo nào khi đụng độ Bayern.

Hồi còn khoác áo Dortmund, anh từng giúp đội bóng áo vàng đen toàn thắng trong 5 lần chạm trán Bayern đầu tiên. Tháng 4/2012, Lewandowski "thông nòng" trước Bayern và nhờ đó Dortmund đã đánh bại gã khổng lồ xứ Bavaria với tỷ số tối thiểu. Thắng lợi quan trọng này giúp Dortmund vô địch Bundesliga vào cuối mùa. Đó chính là mùa giải thứ 2 liên tiếp Lewandowski giành Đĩa bạc cùng Dortmund.

Một tháng sau khi ghi bàn thắng đầu tiên vào lưới Bayern, Lewandowski đã chơi một trong những trận đấu hay nhất sự nghiệp. Hôm ấy anh lập hat-trick giúp Dortmund đè bẹp Bayern 5-2 trong trận chung kết Cúp quốc gia Đức 2011/12. 

Ở mùa giải kế tiếp, Dortmund của Lewandowski thay vì tiếp tục bay cao lại để cho Bayern áp đảo hoàn toàn. Đây là mùa giải Bayern đoạt chức vô địch Bundesliga với 25 điểm nhiều hơn Dortmund xếp thứ 2 (91 so với 66). Ngoài ra, họ còn hạ Dortmund ở Siêu Cúp quốc gia, tứ kết Cúp quốc gia Đức và cả trận chung kết Champions League 2012/13 diễn ra tại Wembley.

Sau khi ghi bàn trong trận tranh Siêu Cúp Đức nói trên, Lewandowski đã không còn làm tung lưới Bayern thêm lần nào ở 9 trận đấu sau đó. Ngoài ra, sau chuỗi 5 trận đầu toàn thắng trước Bayern, lão tướng người Ba Lan chỉ hạ được Hùm xám thêm 2 lần ở 11 lần chạm trán còn lại (hòa 2, thua 7).