Tuy nhiên, theo Mục 8 về việc chuyển đổi ĐTQG được ghi tại chương III - Các điều kiện thi đấu cho Đội tuyển cấp độ Quốc gia, trong Quy định điều chỉnh và áp dụng các điều lệ của FIFA khi đó thì Lee Nguyễn không đáp ứng đủ điều kiện khoác áo ĐT Việt Nam.
Cụ thể, điều 1, 2 và 3 của Mục 8 cho biết, nếu một cầu thủ có nhiều hơn một quốc tịch như trường hợp của Lee Nguyễn thì có thể được một lần thay đổi ĐTQG. Song cầu thủ đó phải đáp ứng các điều kiện mà điều 1 ghi như sau: Thứ nhất, không thi đấu trận nào (hoặc đủ cả trận hoặc một phần trận đấu) thuộc hệ thống giải chính thức cấp độ “A” quốc tế cho ĐTQG hiện tại. Thứ hai, thời điểm lần đầu ra mắt thi đấu trọn vẹn hoặc 1 phần cho ĐTQG hiện tại ở giải đấu chính thức, cầu thủ đó đã có quốc tịch ở ĐTQG mà anh có nguyện vọng đầu quân.
Điều 2, nếu cầu thủ đã thi đấu cho một ĐTQG trong một trận quốc tế nhưng bị mất quốc tịch ở quốc gia đấy vĩnh viễn mà không có sự đồng ý của cầu thủ đó hoặc từ quyết định của chính phủ thì cầu thủ đó có thể yêu cầu được phép chơi cho một ĐTQG khác mà anh có quốc tịch.
Điều 3, bất cứ cầu thủ nào đều có quyền thay đổi ĐTQG nếu đáp ứng hai điều trên và có thể gửi thư đề nghị lên Tổng thư ký FIFA. Sau đó, Ủy ban phụ trách về pháp lý cầu thủ sẽ căn cứ vào các quy định để quyết định. Một khi đề nghị được thông qua, cầu thủ đó sẽ không được phép thi đấu cho bất cứ ĐTQG nào khác nữa.
Lee Nguyễn ra sân trong trận gặp Paraguay tại Copa America
Tháng 7/2007, Lee Nguyễn đã cùng ĐT Mỹ dự Copa America tại Venezuela với tư cách khách mời. Anh vào sân thay người ở hiệp 2 trong trận Mỹ thua 1-3 trước Paraguay và 0-1 trước Colombia. Dù chỉ là khách mời nhưng thành tích của ĐT Mỹ hay Mexico khi đó vẫn được tính. Bởi sau cùng, Mexico giành HCĐ của giải. Ngoài ra, Copa America cũng là một trong những giải đấu chính thức thuộc FIFA. Do vậy các trận đấu của ĐT Mỹ ở giải đấu khi đó vẫn được tính. Đến nay, trên trang chủ FIFA vẫn lưu trữ kết quả những trận đấu của ĐT Mỹ tại Copa America 2007.
Mặt khác, Lee Nguyễn cũng đã thi đấu cho ĐT Mỹ trong thời điểm anh chưa hoàn tất thủ tục nhập tịch Việt Nam.
Với hai yếu tố trên và căn cứ vào luật mà FIFA quy định, tiền vệ đang chơi cho New England Revolution không đủ điều kiện thi đấu cho ĐT Việt Nam.