Stones đang trải qua mùa giải khá khó khăn khi thường xuyên gặp rắc rối với sức khỏe. Trong lần thứ 4 có tên trong đội hình xuất phát Man City ở Premier League 2023/24, anh bị tiền đạo Beto của Everton ngã đè lên người và tỏ ra vô cùng đau đớn.
Dù cũng gắng gượng đứng dậy chơi tiếp, nhưng rút cục Stones vẫn phải rời sân để nhường chỗ cho Gvardiol trước khi hiệp 1 kết thúc (43'). Phát biểu trong cuộc họp báo sau trận đấu giữa Man City và Everton, HLV Guardiola khi được hỏi về tình trạng của chốt chặn người Anh đã tiết lộ: "Stones cần được kiểm tra để đánh giá chính xác mức độ nghiêm trọng của chấn thương. Qua quan sát ban đầu thì mọi thứ có vẻ không tốt, nhưng chúng tôi sẽ chờ kết luận của bác sỹ để đưa ra giải pháp tiếp theo".